15、16日に23都府県で選手権予選決勝が行われ、番狂わせが各地で起こった。三重ではU-17日本代表FW小林颯、主将のDF中田永一など昨年度の選手権4強メンバーが数多く残る四日市中央工が決勝で宇治山田商に1-3と敗れた。宇治山田商は初の選手権出場となる。滋賀では高校総体で全国16強に入った野洲が草津東に敗れた。草津東はFW山本悠樹など前線にスピードのある選手をそろえており、今大会の台風の目となるかもしれない。
高校総体を制した東福岡は苦戦しながらも、決勝で九州国際大付を1-0で下し、全国行きを決めた。J入りが濃厚なMF増山朝陽、MF中島賢星は相手の徹底マークにあい持ち味を発揮できなかったが、全国ではその力を存分に発揮してくれるだろう。来季、鳥栖への加入内定が発表されたDF笹原脩平と群馬への加入内定が発表されたMF大岩亮太の二人を擁する熊本の秀岳館は決勝で東海大星翔と対戦。試合は延長に突入する熱戦となったが、延長後半ロスタイムに決勝点が決まるという劇的な結末で秀岳館が初の選手権出場を決めた。